Klaipėdos universitetas šiandien – dinamiškas, augantis daugiasritis universitetas, per daugiau nei trejus veiklos dešimtmečius išgryninęs mokslinės bei akademinės veiklos kryptis. Universitetą sudaro 2 mokslo institutai – Baltijos regiono istorijos ir archeologijos bei Jūros tyrimų, kuriuose koncentruotos gausios mokslininkų tyrėjų pajėgos bei tuo pat metu vykdomos studijos. Trys fakultetai – Jūros technologijų ir gamtos mokslų, Socialinių ir humanitarinių mokslų bei Sveikatos mokslų – padaliniai, kuriuose dominuoja akademinė dvasia bei plėtojami mokslo projektai.